新冠病毒精確完整基因注釋圖譜完成

    2021-05-12 14:51 | 來源:科技日報 | 作者:劉霞 | [科技] 字號變大| 字號變小


    為確定這些蛋白質(zhì)編碼基因,計(jì)算機(jī)科學(xué)和人工智能實(shí)驗(yàn)室的瑪諾里斯·克里斯教授領(lǐng)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)利用自己開發(fā)出的計(jì)算技術(shù),對新冠病毒、薩斯病毒和42株蝙蝠沙貝病毒亞屬進(jìn)行...

            美國麻省理工學(xué)院的科學(xué)家在11日出版的《自然·通訊》雜志撰文稱,在進(jìn)行了廣泛的比較基因組學(xué)研究之后,他們繪制出了新冠病毒迄今最精確完整的基因注釋圖譜,確認(rèn)了幾種蛋白質(zhì)編碼基因,也發(fā)現(xiàn)有些基因并不編碼任何蛋白質(zhì)。此外,他們還分析了新冠病毒不同毒株產(chǎn)生的近2000個突變,從而能更好地評估這些突變的重要性。

            新冠病毒的基因組由近30000個RNA堿基組成。此前科學(xué)家已經(jīng)根據(jù)與相關(guān)病毒中蛋白質(zhì)編碼基因的相似性,確定了一些能編碼蛋白質(zhì)的基因。他們認(rèn)為,另外還有些基因能編碼蛋白質(zhì),但它們并沒有明確歸類為蛋白質(zhì)編碼基因。

            為確定這些蛋白質(zhì)編碼基因,計(jì)算機(jī)科學(xué)和人工智能實(shí)驗(yàn)室的瑪諾里斯·克里斯教授領(lǐng)導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)利用自己開發(fā)出的計(jì)算技術(shù),對新冠病毒、薩斯病毒和42株蝙蝠沙貝病毒亞屬進(jìn)行了分析。這一技術(shù)的基本原理是分析物種之間是否保存著某些DNA或RNA堿基,并比較它們隨時間如何進(jìn)化,他們此前已利用該技術(shù)比較了人類基因組與其它哺乳動物的基因組。

            結(jié)果表明,除發(fā)現(xiàn)此前已在其他冠狀病毒中發(fā)現(xiàn)的5個基因外,克里斯團(tuán)隊(duì)還確認(rèn)了新冠病毒基因組中6個蛋白質(zhì)編碼基因,而其他5個被認(rèn)為能編碼蛋白的基因并無此能力。他們表示,在分析了整個基因組后,非常確信沒有其他蛋白質(zhì)編碼基因成為“漏網(wǎng)之魚”。他們計(jì)劃繼續(xù)開展實(shí)驗(yàn)研究,以弄清這些沒有特征的基因的功能。

            此外,克里斯團(tuán)隊(duì)還分析了自新冠病毒首次被發(fā)現(xiàn)以來,已經(jīng)出現(xiàn)的1800多個突變,并比較了每個基因在過去的進(jìn)化速度和疫情暴發(fā)以來的進(jìn)化速度。結(jié)果表明,大多數(shù)情況下,在疫情暴發(fā)之前長時間快速進(jìn)化的基因仍在繼續(xù)快速進(jìn)化,而緩慢進(jìn)化的基因也保持著自身的節(jié)奏。不過也有例外,這可能有助于揭示病毒在適應(yīng)新的人類宿主時是如何進(jìn)化的。

            研究人員還分析了幾種新冠病毒變異毒株——B.1.1.7、P.1和B.1.351等出現(xiàn)的突變。結(jié)果發(fā)現(xiàn),許多使這些變異更危險的突變存在于刺突蛋白中,有助于病毒更快地傳播并避開免疫系統(tǒng)。他們指出,每個變異毒株都擁有20多個獨(dú)特的突變,知道哪些可能有用,哪些無用非常重要,有助于科學(xué)家專注最有可能對病毒傳染性產(chǎn)生重大影響的突變。

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